Еще в 2006 году, рассказывая о манги, художник рассказывал, что у него есть кое-какие задумки по поводу сюжета и написания последней главы. При том Кисимото, замечал, что на это может уйти много времени, ввиду наличия огромного количества ждущих разрешения в ходе повествования проблем.

Работая в это время над мангой носящей название «Karakuri», Кисимото сделал множество набросков, однако не был ими доволен и решил посветить себя следующему проекту, в результате вылившемуся в мангу Наруто.

Художник довольно часто рассказывал о процессе рождения манги в своих многочисленных интервью. Окружающая обстановка придуманного мира, к примеру, по его словам, была выдумана без продолжительных размышлений, спонтанно. Впрочем, Масаси был обязан признать, что при рисовании образцом одного из основных первостепенных мест действия, села Конохи, он рисовал ландшафт Окаямы, своей близкой префектуры в Японии. Стараясь, чтобы его действующие лица были насколько это возможно отличны от героев других манг, он тем не менее возвращался к одному из метажанров под названием сёнэн в черпая вдохновения при создании разных персонажей.